软件简介
Stereo Data Analysis Solution (SDAS)软件
STOmics开发的一套时空组学数据高级生物信息分析软件,专为时空组学数据(STOmics平台数据)提供全流程数据分析解决方案。
功能模块:包含14个功能模块,共31个算法/方法。具体有:数据处理,细胞类型注释,空间结构域识别,细胞邻域分析,CNV分析,空间基因共表达,差异基因识别,基因集富集分析,基因调控网络分析,细胞通讯分析,轨迹分析,转录因子分析,细胞空间距离分析,和公共数据库验证。
输入:h5ad文件(如SAW count,SAW convert gef2h5ad生成),SAW aggr生成的h5mu文件,rds文件 输出:h5ad,rds,csv,txt,png和pdf文件
输出:h5ad,rds,csv,txt,png和pdf文件

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