st.h5ad:空间转录组表达矩阵AnnData对象,要求包含原始表达矩阵、空间坐标等信息。具体请参考SDAS输入数据格式描述。
st.h5ad
./moran.csv:已经计算好的基因莫兰指数文件,(包含了squidpyarrow-up-right分析的Moran's I 指数分析的结果,前2列为必需列:与h5ad一致的基因名称和moranI),以逗号分隔,示例内容如下:
./moran.csv
ENSG00000164433
0.8273024881077159
0.0
0.0001022749701474042
FABP5
ENSG00000106078
0.8203151436536835
STX3
ENSG00000170260
0.7993499975159156
HSPB1
ENSG00000163220
0.797949719212986
S100A9
ENSG00000187021
0.7868677451739036
NTS
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