# 输入文件示例

## 表达矩阵文件格式说明

* `st.h5ad`：SAW生成的单片或多片空间转录组表达矩阵AnnData对象，要求包含**原始表达矩阵**、**空间坐标**等信息。具体请参考[SDAS输入数据格式描述](https://github.com/STOmics/StereoMap/blob/sdas-manual-1.0/readme/04_manual/sdas_input.md)。
* `st.h5mu`：SAW aggr输出的多模态数据文件，可通过h5mu2h5ad转换为h5ad。
* `mult.csv`：多片合并时的输入文件。
  * 首行以#开头为表头，内容包括样本名、分组信息、h5ad绝对路径，以逗号分隔，示例内容如下：
  * 合并后的adata文件中，样本和分组信息分别存于adata.obs\['sampleID']和adata.obs\['group']

<pre><code><strong>#sample,group,path
</strong>sample1,groupA,sample1.h5ad.path
sample2,groupB,sample2.h5ad.path
</code></pre>