输入文件示例
h5ad数据格式说明
st.h5ad
:空间转录组表达矩阵AnnData对象,要求包含原始表达矩阵、基因名、差异分析分组等信息。具体请参考SDAS输入数据格式描述使用DESeq2或edgeR进行有生物学重复样本的差异分析时,必须使用原始表达矩阵。
h5ad文件的key和value中避免出现空格、/、+、,、~等特殊字符,否则可能导致流程报错
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st.h5ad
:空间转录组表达矩阵AnnData对象,要求包含原始表达矩阵、基因名、差异分析分组等信息。具体请参考SDAS输入数据格式描述
使用DESeq2或edgeR进行有生物学重复样本的差异分析时,必须使用原始表达矩阵。
h5ad文件的key和value中避免出现空格、/、+、,、~等特殊字符,否则可能导致流程报错
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