输入文件示例

基因列表文件

  • --input自定义基因列表文件,无表头,每行一个基因名(不可为gene id)

CA8

NDRG1

DEFB1

CYP2W1

NAPRT

STRING数据库文件(非必须)

  • 可选:若为human或mouse,直接输入物种参数即可,若为自定义物种,输入--links_db与--aliases_db参数

  • links_db:蛋白互作关系文件(如:9606.protein.links.v12.0.txt)

  • aliases_db:蛋白别名文件(如:9606.protein.aliases.v12.0.txt)

STRING数据库说明

  • 内置数据库来源:https://cn.string-db.org/cgi/download?sessionId=bq3ONpHVnJ16V12.0

  • 自定义数据库构建可参考STRING官网:https://cn.string-db.org/

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