输入文件示例
基因列表文件
--input
自定义基因列表文件,无表头,每行一个基因名(不可为gene id)
CA8
NDRG1
DEFB1
CYP2W1
NAPRT
STRING数据库文件(非必须)
可选:若为human或mouse,直接输入物种参数即可,若为自定义物种,输入--links_db与--aliases_db参数
links_db:蛋白互作关系文件(如:9606.protein.links.v12.0.txt)
aliases_db:蛋白别名文件(如:9606.protein.aliases.v12.0.txt)
STRING数据库说明
内置数据库来源:https://cn.string-db.org/cgi/download?sessionId=bq3ONpHVnJ16V12.0
自定义数据库构建可参考STRING官网:https://cn.string-db.org/
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