# 性能测试

## Stereo-seq测试数据

| 样本               | 细胞数目      | 细胞类群(个) |
| ---------------- | --------- | ------- |
| sample1\_bin100  | 17,884    | 29      |
| sample1\_bin50   | 70,761    | 38      |
| sample1\_bin20   | 439,383   | 39      |
| sample1\_cellbin | 134,703   | 39      |
| sample2\_bin100  | 23,061    | 11      |
| sample2\_bin50   | 91,106    | 11      |
| sample2\_bin20   | 5,643,322 | 11      |

## 运行时间与内存占用

* Squidpy：运行时间/内存随着细胞数增加而增大，不同binsize运行时间均在1小时以内可完成， bin20的内存会显著增加；
* CRAWDAD：运行时间/内存随着细胞数增加而增大，不同binsize内存均在10G以内，bin20的运行时间会显著增加；
* CRAWDAD：运行时间受--crawdad\_perms影响极大，增加此值会提高p值的准确性但增加计算时间。默认推荐10

<div><figure><img src="https://2512275466-files.gitbook.io/~/files/v0/b/gitbook-x-prod.appspot.com/o/spaces%2FaaKaKxoqTIFT7FAUUQFl%2Fuploads%2FqF4M49lXOejrIIWcBqko%2Fperformance_memory.png?alt=media&#x26;token=7815e54a-8a3f-4b03-be9b-b58d35e128ed" alt=""><figcaption></figcaption></figure> <figure><img src="https://2512275466-files.gitbook.io/~/files/v0/b/gitbook-x-prod.appspot.com/o/spaces%2FaaKaKxoqTIFT7FAUUQFl%2Fuploads%2FWkHnr9zVke8rPbtrX5sf%2Fperformance_time.png?alt=media&#x26;token=248f9655-a55c-47e2-a0ef-6027515ee3c8" alt=""><figcaption></figcaption></figure></div>