# 版本说明

## SDAS发版记录 <a href="#saw-fa-ban-ji-lu" id="saw-fa-ban-ji-lu"></a>

#### 1.0.0（8月, 2025） <a href="#id-8208-yue-2025" id="id-8208-yue-2025"></a>

* **初次发版**&#x20;
  * 包含14个功能模块，共31个算法/方法。具体有：数据处理，细胞类型注释，空间结构域识别，细胞邻域分析，CNV分析，空间基因共表达，差异基因识别，基因集富集分析，基因调控网络分析，细胞通讯分析，轨迹分析，转录因子分析，细胞空间距离分析，和公共数据库验证。

#### 1.0.1（5月, 2026） <a href="#id-8208-yue-2025" id="id-8208-yue-2025"></a>

* **问题修复**
  * 修复基因名称解析 Bug：解决 R 转换 h5ad 时，基因名中**横杠 / 下划线**被判定为重复的问题，同步更新所有相关模块
  * 兼容新版文件格式：修复写入 SAW v8.2+ cellbin 格式 h5ad 的报错，更新所有 anndata 写入模块
  * 优化性能与日志：关闭富集模块冗余日志，统一`gene_symbol_key`处理逻辑并全模块联调
  * 细胞注释功能修复
    1. 解决 cell2location 因单元格数量与批次取余为 1 导致运行失败问题
    2. 升级 lightning 至 2.4.0 及以上，修复随机种子日志重复打印问题
    3. 修复 spotlight 标签以数字开头、RCTD 细胞类型含斜线引发的报错
    4. 新增`SDAS_LOG_LEVEL`/`LOG_LEVEL`环境变量，支持自定义日志级别
    5. 优化参数校验，错误 GPU 编号等场景不再打印 argparse 使用说明
  * 空间基因共表达：修复莫兰指数文件索引读取类型错误导致的格式兼容问题

## 历史版本 <a href="#li-shi-ban-ben" id="li-shi-ban-ben"></a>

历史版本信息可以从 [GitHub](https://github.com/STOmics/SDAS) 获取。


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# Agent Instructions: Querying This Documentation

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```
GET https://mysite.gitbook.io/sdas_manual_cn/readme/06_version.md?ask=<question>
```

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