{"version":1,"pages":[{"id":"qErb7ZihUo3tGEFVd0ad","title":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册","pathname":"/sdas_manual_cn","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","description":"版本：SDAS 1.0.0"},{"id":"PiebPEywiI6IPrR9HMqD","title":"软件简介","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/01_sdas_intro","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"}]},{"id":"8Pyo4520BmAP6InFB6L8","title":"安装指南","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/02_install","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","description":"","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"}]},{"id":"KeBNR5fetiLnfiKVEvRT","title":"快速入门","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/03_quickstart","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"}]},{"id":"i4RA1ZxRJuX3dz5ACGIY","title":"各功能模块使用说明","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"}]},{"id":"zoIxj7O3L2AHRnyWhjjA","title":"SDAS输入数据格式描述","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/sdas_input","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"}]},{"id":"0NbBaV4xdyZCttjijb8n","title":"性能测试环境和数据描述","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/sdas_test_data","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"}]},{"id":"I1xiMQVxRO1MaHyKFryI","title":"数据处理","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/dataprocess","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"}]},{"id":"lLNJYKe76nqUiZ450mXu","title":"简介","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/dataprocess/01_intro","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"数据处理"}]},{"id":"pOntCbutcrO3prBdU3Xm","title":"输入文件示例","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/dataprocess/02_input","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"数据处理"}]},{"id":"OHdRmrmseHFKUF3rnJuE","title":"运行命令说明","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/dataprocess/03_function","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"数据处理"}]},{"id":"cAtwrA6pnD9DNkTsupnS","title":"细胞类型注释","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_annotation","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"}]},{"id":"ZXm6jokEFyxW6mexfd1P","title":"简介","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_annotation/01_intro","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞类型注释"}]},{"id":"rfzmIXQlBcYQiKlo6of0","title":"h5ad数据格式说明","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_annotation/02_input","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞类型注释"}]},{"id":"S7UXeYRk2aFPkrNt5hOL","title":"cell2location算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_annotation/03_cell2location","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞类型注释"}]},{"id":"XkHKmKS3XFAA1MUFAqNY","title":"构建单细胞参考数据","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_annotation/03_cell2location/01_ref","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞类型注释"},{"label":"cell2location算法"}]},{"id":"RtoNzt81nJI8Qor0sv4n","title":"细胞注释","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_annotation/03_cell2location/02_anno","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞类型注释"},{"label":"cell2location算法"}]},{"id":"4mrBbaleuXFHwTyu8jbv","title":"RCTD算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_annotation/04_rctd","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞类型注释"}]},{"id":"k4Fkt8Vy8dQfzNJFtrm1","title":"Tangram算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_annotation/05_tangram","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞类型注释"}]},{"id":"tKMU9ZsQTbpjW1cZPxM1","title":"SCimilarity算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_annotation/06_scimilarity","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞类型注释"}]},{"id":"OydExsJd77f3xvswO94K","title":"构建单细胞参考数据 (非必须)","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_annotation/06_scimilarity/01_ref","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞类型注释"},{"label":"SCimilarity算法"}]},{"id":"vTC5vhRHYCszgMm2a8jp","title":"细胞注释","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_annotation/06_scimilarity/02_anno","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞类型注释"},{"label":"SCimilarity算法"}]},{"id":"KJdmKqBJMT7FL1LQ92tF","title":"SPOTlight算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_annotation/07_spotlight","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞类型注释"}]},{"id":"rZa8xDk5qqWePOr1JAsr","title":"性能测试","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_annotation/08_performence","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞类型注释"}]},{"id":"UPSufmq4pki4uEIINnxD","title":"空间结构域识别","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/spatial_domain","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"}]},{"id":"knWyPI1YMqiqHkJeY12F","title":"简介","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/spatial_domain/01_intro","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"空间结构域识别"}]},{"id":"tLb0DDDdp5d5rpFwQRua","title":"h5ad数据格式说明","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/spatial_domain/02_input","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"空间结构域识别"}]},{"id":"Glgc2GeFLs5VZUmzO5R8","title":"graphST算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/spatial_domain/03_graphst","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"空间结构域识别"}]},{"id":"8Mcb6vnvYph2jAAKEMV0","title":"性能测试","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/spatial_domain/xing-neng-ce-shi","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"空间结构域识别"}]},{"id":"bwjrNR9dp8vs7jIqKy1r","title":"细胞邻域分析","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_neighborhood","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"}]},{"id":"FqvDB4y6sTPFS2TDwaI0","title":"简介","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_neighborhood/01_intro","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞邻域分析"}]},{"id":"MxsLFbEdD78Ul08pneiy","title":"单一细胞类型模式","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_neighborhood/02_singlecell","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞邻域分析"}]},{"id":"6RIhsOk5ys6bXJl8Y1t8","title":"细胞类型分数模式","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_neighborhood/03_multicell","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞邻域分析"}]},{"id":"HWaE3rRrs74DZMYiGqJ4","title":"性能测试","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cell_neighborhood/04_perfermence","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞邻域分析"}]},{"id":"Mu6QGMYZT1xKU1oIEfJY","title":"CNV分析","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cnv","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"}]},{"id":"YC2LAnFPFJGr4fUJir4A","title":"简介","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cnv/01_intro","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"CNV分析"}]},{"id":"YsPcgNdG7lrLJ2m8A6TX","title":"输入文件示例","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cnv/02_input","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"CNV分析"}]},{"id":"VY5ZFmm1d1BQInmpPElG","title":"InferCNV算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cnv/03_infercnv","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"CNV分析"}]},{"id":"XVBD154jj8obpkThgWVQ","title":"性能测试","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cnv/04_performence","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"CNV分析"}]},{"id":"x4CNPUI1DtCBy5PQZ9CT","title":"空间基因共表达","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/coexpress","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"}]},{"id":"vVRWIrsPqSTbmMAk9ddL","title":"简介","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/coexpress/01_intro","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"空间基因共表达"}]},{"id":"aZOPIZ2Z9uP3bKjatNM8","title":"输入文件示例","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/coexpress/02_input","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"空间基因共表达"}]},{"id":"9bXqbPHQkswjnZhvTVml","title":"hdWGCNA算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/coexpress/03_hdwgcna","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"空间基因共表达"}]},{"id":"3mOGFbm7yZ2JtZcupKb7","title":"Hotspot算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/coexpress/04_hotspot","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"空间基因共表达"}]},{"id":"qULux2edccsPRKUP0TXU","title":"NeST算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/coexpress/05_nest","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"空间基因共表达"}]},{"id":"PrKYHvmKMtu1uXEFlOiq","title":"性能测试","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/coexpress/06_performence","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","description":"","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"空间基因共表达"}]},{"id":"TJRYonYCirEgEoxACRLL","title":"差异基因分析","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/deg","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"}]},{"id":"FU0yqQ3tKInRSC2T4XWI","title":"简介","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/deg/01_intro","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"差异基因分析"}]},{"id":"PhqqgoBEEkJOP27Jct6r","title":"输入文件示例","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/deg/02_input","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"差异基因分析"}]},{"id":"6eGBbfMAQqWLsXwjxZMX","title":"单细胞/pseudobulk差异分析","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/deg/03_deg","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"差异基因分析"}]},{"id":"aLsCJcyNMlU6s5N8BNRN","title":"性能测试","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/deg/04_performence","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"差异基因分析"}]},{"id":"JjfVIo3k3hv6z3prPRr7","title":"基因富集分析","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/geneset_enrichment","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"}]},{"id":"fpQQS5NpSk5tYoeWPB7J","title":"简介","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/geneset_enrichment/01_intro","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"基因富集分析"}]},{"id":"MBUpbTftMp9Ugf2xgMgq","title":"输入文件示例","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/geneset_enrichment/02_input","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"基因富集分析"}]},{"id":"ycXdn3L19wlI2DJALpI1","title":"GSEA算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/geneset_enrichment/03_gsea","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"基因富集分析"}]},{"id":"qNYI1xMBXk0QMmuk70xu","title":"GSVA算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/geneset_enrichment/04_gsva","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"基因富集分析"}]},{"id":"jnYTiqenCrpqXBGzSxeh","title":"Enrichr算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/geneset_enrichment/05_enrich","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"基因富集分析"}]},{"id":"JcGVxyCbgP94XVwL5v7w","title":"Prerank算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/geneset_enrichment/06_prerank","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"基因富集分析"}]},{"id":"dXCF5RmP687bECP15NmO","title":"性能测试","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/geneset_enrichment/07_performence","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"基因富集分析"}]},{"id":"fjWKU5TrgHybsINOC1ZO","title":"蛋白互作网络分析","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/ppi","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"}]},{"id":"5GarZxf09aO5v2U7UuJV","title":"简介","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/ppi/01_intro","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"蛋白互作网络分析"}]},{"id":"zL7NPt46mN0XWmjJZ62k","title":"输入文件示例","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/ppi/02_input","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"蛋白互作网络分析"}]},{"id":"ARIkHHvt3ev7WKTtDVvm","title":"GN/MCL/Kmeans聚类","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/ppi/03_function","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"蛋白互作网络分析"}]},{"id":"vTLRhCEy4XQNIeJZ26EP","title":"细胞通讯分析","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cci","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"}]},{"id":"kbPwwRh6d6oMw8J0J2BK","title":"简介","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cci/01_intro","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞通讯分析"}]},{"id":"bIuHKUgV2YaPRRYhaQpi","title":"输入文件示例","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cci/02_input","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞通讯分析"}]},{"id":"YvmcadGsXIEZAckgpQUn","title":"cellchat算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cci/03_cellchat","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞通讯分析"}]},{"id":"WxSOMJsOy2E3mYzaJxi7","title":"cellphonedb算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cci/04_cellphonedb","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞通讯分析"}]},{"id":"gqvAtBh8OPQM771piphC","title":"性能测试","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/cci/05_performence","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞通讯分析"}]},{"id":"03VhcOQ5zLBQ2aK5NSDu","title":"轨迹分析","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/trajectory","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"}]},{"id":"xNVjLNsJNySdvSdTQY4v","title":"简介","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/trajectory/01_intro","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"轨迹分析"}]},{"id":"cp7mkwtNVp340viSMgdf","title":"输入文件示例","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/trajectory/02_input","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"轨迹分析"}]},{"id":"GQVpOvgeVVhADCSoFIid","title":"monocle3算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/trajectory/03_monocle3","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"轨迹分析"}]},{"id":"cCQemb9Bcl8030sPjJrL","title":"性能测试","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/trajectory/04_performence","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"轨迹分析"}]},{"id":"irzpaZhe3hlTNRW2KqVE","title":"转录因子分析","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/tf","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"}]},{"id":"VeGri5lQGOqGUxYYY9rz","title":"简介","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/tf/01_intro","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"转录因子分析"}]},{"id":"hqoXqWaBZ0V8hNyffhFs","title":"输入文件示例","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/tf/02_input","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"转录因子分析"}]},{"id":"spvM6684Ia90JYMQ8XIr","title":"pyscenic算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/tf/03_pyscenic","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"转录因子分析"}]},{"id":"ARjPAJpY9V1d5FTGTaJD","title":"性能测试","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/tf/04_performence","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"转录因子分析"}]},{"id":"lPSOjGx0JD8ojcxCTQ5a","title":"细胞空间距离关系分析","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/spatial_relate","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"}]},{"id":"PF5ynCtWUV1rkrpByJps","title":"简介","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/spatial_relate/01_intro","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞空间距离关系分析"}]},{"id":"bf6eX50emdGqchpuZNJc","title":"输入文件示例","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/spatial_relate/02_input","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞空间距离关系分析"}]},{"id":"n1OrKq01lnW9e1O1PKoY","title":"Squidpy算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/spatial_relate/03_squidpy","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","description":"","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞空间距离关系分析"}]},{"id":"5Bzsc6T2gAjhuH6OCruK","title":"CRAWDAD算法","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/spatial_relate/04_crawdad","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞空间距离关系分析"}]},{"id":"8nwggi5O9WY9sFTcntLP","title":"性能测试","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/spatial_relate/05_performence","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"细胞空间距离关系分析"}]},{"id":"L42zw77jif6kDg7SIJfO","title":"公共数据库验证","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/bulk_validate","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"}]},{"id":"70lV8iYh4vKhZVVsQvIg","title":"简介","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/bulk_validate/00_intro","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","description":"","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"公共数据库验证"}]},{"id":"pC4wVLdahl9Iw5cAyU4U","title":"免疫浸润分析模块","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/bulk_validate/01_immune","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"公共数据库验证"}]},{"id":"AKLGNH6kGCHbcOLoy4Oy","title":"基因集评分模块","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/bulk_validate/02_geneset","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"公共数据库验证"}]},{"id":"3iYC1RtU406YPUnvhjZk","title":"生存分析模块","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/04_manual/bulk_validate/03_survival","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"各功能模块使用说明"},{"label":"公共数据库验证"}]},{"id":"EGgKr90hOWotIpWA5x0m","title":"流程示例","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/05_pipline","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","description":"","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"}]},{"id":"pTUomJet8hPFPTgVPXAq","title":"集群投递模式","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/05_pipline/02_qsub","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","description":"","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"流程示例"}]},{"id":"JE2MGu2qJ9sBBF0oYQnw","title":"单机服务器模式","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/05_pipline/01_single","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"流程示例"}]},{"id":"ZcFCpaZ5wk9XvypPC8fF","title":"版本说明","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/06_version","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"}]},{"id":"RCUMsTOY5PfyI5Lsr7Pv","title":"技术支持","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/07_support","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"}]},{"id":"UQ1eXQaJOrgTE2iC6a9R","title":"常见问题","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/07_support/faq","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"技术支持"}]},{"id":"axXQfF55RU6F3V5JX8ZV","title":"SDAS日志和退出码规范","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/07_support/log","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"技术支持"}]},{"id":"d6I03ye3Gl7tMthdUsI3","title":"SAW aggr(alpha ver.)流程介绍","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/07_support/saw_aggr","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"技术支持"}]},{"id":"Tiqgp2IsmnQFA3ZTXYzj","title":"参考文献及Github","pathname":"/sdas_manual_cn/readme/07_support/reference","siteSpaceId":"sitesp_gHvEK","breadcrumbs":[{"label":"时空数据分析软件（SDAS）使用手册"},{"label":"技术支持"}]}]}