性能测试

运行时间与内存占用

• 性能测试使用n_cpus或n_threads=24，GPU为NVIDIA T4 16G

• 运行时间：cell2location > spotlight > RCTD > tangram > scimilarity

• 内存：spotlight > cell2location > RCTD/tangram/scimilarity

• cell2location/spotlight内存需求与细胞数量呈显著正相关，RCTD/Tangram/scimilarity内存需求在不同大小的数据上比较一致

• GPU使用情况：cell2location所有bin size都可以在16G显存的GPU上运行；tangram bin100和bin50在GPU上运行，cellbin和bin20在CPU上运行；scimilarity所有bin size都可以在16G显存的GPU上运行，使用CPU和GPU在运行时间上无显著差别