性能测试
运行时间与内存占用
使用不同bin数量的数据进行gsea和gsva测试,统计运行时间和运行内存。测试结果显示超过200k数量的bin/cell时gsea无法正常运行,gsva需要消耗大量的计算资源。这种情况可以通过对bin/cell的数据进行随机采样(设置降采样参数--sample_size 200000)来降低数据量,再进行分析。

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使用不同bin数量的数据进行gsea和gsva测试,统计运行时间和运行内存。测试结果显示超过200k数量的bin/cell时gsea无法正常运行,gsva需要消耗大量的计算资源。这种情况可以通过对bin/cell的数据进行随机采样(设置降采样参数--sample_size 200000)来降低数据量,再进行分析。
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