性能测试
运行时间与内存占用
建议:pyscenic构建转录因子与基因之间的共表达网络需要用到随机森林算法,当细胞数增加时,运行时间和内存指数增加。 推荐分析时,针对目标细胞先进行筛选再进行分析。
运行时间和内存与细胞数成正比,细胞数越多,资源需求越高
推荐优先筛选目标细胞亚群后分析
参考性能(n_cpus=24)
样本
细胞数
运行时间(h)
内存(G)
sample1
20629
7.8
23
sample2
21500
13.7
29
sample3
81843
23
79
sample4
84510
37.5
108
sample5
321856
>96
>200

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